La saison débute mal pour Balotelli et les siens avec une défaite lors de la Community Shield 2011 sur le score de (2-3) face au grand rival de Manchester United. Lors de la défaite parisienne face à l’Olympique lyonnais, il s’en va violemment percuter Anthony Lopes lors d’une sortie de celui-ci, et est obligé de sortir sur blessure. Le 12 mai 2013, il est officiellement champion de France avec le Paris Saint-Germain lors d’une victoire 1-0 contre l’Olympique lyonnais.